MySQL是一個廣泛使用的關系型數據庫管理系統，它提供了高效、可靠、靈活的方案，但同時也存在一些局限性。

存儲限制：在處理大數據量時，MySQL會遇到存儲限制的問題。基于單機的MySQL在處理大數據時，可能會遇到存儲容量不足的問題，導致無法存儲更多的數據。雖然可以通過分區、分表、sharding等方式來解決這個問題，但是相對來說，這些方法增加了數據庫的復雜度。

處理并發：MySQL的并發處理能力存在一些限制，這會導致大量的請求會等待獲得鎖或者等待I/O操作的完成。這些問題可能導致應用性能的下降或者一些特定業務場景下的系統崩潰。可以通過添加更多的CPU和內存來解決這個問題，但是這些方式是昂貴的。

運行效率問題：盡管MySQL一直在發展和改進，但是與一些非關系型數據庫相比，MySQL的性能可能會下降。這主要是因為MySQL是基于固定模式的關系型數據庫，而非關系型數據庫通常是沒有固定結構的。這就導致MySQL在查詢、寫入和更新時可能會有更多的開銷。

缺乏擴展性：MySQL的架構并不是為大規模分布式集群環境設計的，因此，要在MySQL中實現高可用性和可擴展性是非常困難的。采用一些較為成熟的解決方案，如分區、分片和復制等可以減輕這種不足，但是這些方法也會增加系統的維護成本。

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MySQL雖然存在一些局限性，但它仍然是廣泛應用的關系型數據庫系統之一，尤其是在小規模系統或需要事務處理的系統中，MySQL具有可靠性和安全性。