MySQL作為一款常用的數據庫軟件，數據安全備份和恢復是至關重要的。一旦數據文件損壞，只有進行數據文件恢復才能恢復數據。

在MySQL數據庫中，數據文件包括.ibd文件和.frm文件。其中，.ibd文件是數據表獨立于整個數據庫的表空間，保存了表數據和索引數據。.frm文件則保存了表結構信息。

如果MySQL數據庫中的.ibd文件損壞，那么只能進行數據文件恢復。具體步驟如下：

1. 關閉MySQL數據庫服務；
2. 將損壞的.ibd文件從數據庫中刪除；
3. 備份最新的.ibd文件，復制到原來的位置上；
4. 打開MySQL數據庫服務；
5. 如果能正常打開并訪問數據庫，說明恢復成功。

需要注意的是，進行恢復操作前一定要先備份好損壞的文件，以防數據丟失。

在進行.ibd文件恢復時，如果MySQL數據庫中的.frm文件沒有損壞，那么仍然可以通過alter table命令恢復數據。具體步驟如下：

1. 使用show create table tablename命令獲取建表語句；
2. 使用alter table tablename discard tablespace命令刪除表空間；
3. 使用alter table tablename import tablespace命令導入.ibd文件；
4. 使用show table tablename命令查看表數據是否正常。

總的來說，MySQL數據庫數據文件損壞時只能進行數據文件恢復，需要謹慎操作并備份好數據，以保證數據庫數據的安全性。