在使用MySQL創建庫（database）時，實際上會在服務器中創建一個文件夾來存儲相應的數據。這個文件夾的名稱就是庫的名稱，而其中的文件及其存儲方式，則由MySQL自動管理。

具體的文件存儲結構，可以通過查詢MySQL的數據字典來查看。其中，最主要的文件是與具體的表（table）相對應的數據文件。這個數據文件的名稱與表的名稱相同，然后還會有一些模板文件、日志文件及配置文件等。

CREATE DATABASE mydatabase;

上述命令就是在MySQL中創建一個名為“mydatabase”的數據庫。在執行這個命令時，MySQL會在服務器中創建一個名字為“mydatabase”的文件夾，作為這個庫的存儲位置。在MySQL中訪問這個庫時，實際上就是在訪問這個文件夾中的相關數據文件。

需要注意的是，即使是同一個MySQL服務器中的不同庫，其文件存儲結構也是獨立的，不會互相影響。這也意味著，刪除一個庫時，服務器中對應的文件夾及其中的數據文件也會被一并刪除。