MySQL的主鍵索引和聚簇索引是數據庫中非常重要的索引類型。雖然這兩種索引的作用類似，但是它們卻有著非常大的區別。

首先，主鍵索引是一種對表的主鍵進行索引的方式。主鍵是一張表中每行數據的唯一標識符，MySQL默認使用主鍵作為表的聚簇索引。主鍵索引能夠提高表的查詢效率，因為它可以重復地組織數據，使得查詢的數據總量大大減小。

而聚簇索引則是指MySQL將查詢結果按照主鍵的值來組織在一起的索引。聚簇索引可以提高查詢性能，因為數據可以按照查詢的條件來進行排序，這樣查詢結果可以更快地返回。

-- 創建主鍵索引的語句
CREATE TABLE student (
id INT PRIMARY KEY,
name VARCHAR(20),
age INT
);
-- 創建聚簇索引的語句
CREATE TABLE student (
id INT PRIMARY KEY,
name VARCHAR(20),
age INT
) ENGINE=InnoDB;

需要注意的是，當表中沒有主鍵的時候，MySQL會自動創建一個聚簇索引來代替主鍵索引。聚簇索引的默認順序是升序，如果需要更改順序，可以使用DESC關鍵字來進行指定。

總之，主鍵索引和聚簇索引在MySQL中都非常重要。根據表的不同情況，選擇不同的索引類型可以有效地提高查詢性能和數據存儲效率。