MySQL是一種流行的開源數據庫，在web應用程序和網站開發中經常用到，尤其是LAMP（Linux，Apache，MySQL和PHP）堆棧。在使用MySQL時，一些基本操作是初始化MySQL數據庫。以下是使用命令行界面初始化MySQL 5.6的步驟。

$ sudo service mysql stop  //停止MySQL服務，如果正在運行。
$ sudo mysqld_safe --skip-grant-tables &  //啟動MySQL安全模式，跳過權限檢查。
$ mysql -u root  //連接到MySQL服務器。
mysql>use mysql  //選擇默認的MySQL數據庫。  
mysql>update user set authentication_string=PASSWORD('NewPassword') where User='root';  //更改root用戶的密碼，將NewPassword替換為您新的密碼。
mysql>flush privileges;  //刷新權限。
mysql>exit  //退出MySQL服務器。
$ sudo pkill mysqld; sudo service mysql start  //殺死任何正在運行的MySQL進程并重新啟動MySQL服務。

通過以上步驟，您已成功完成MySQL 5.6的初始化過程，并更改了root用戶的密碼。建議定期更改數據庫密碼以增強安全性。