MySQL的IN操作可以使用索引，但需要注意一些限制條件。

首先，在使用IN操作時，如果IN列表中的元素個數比較少，例如小于等于3個，那么MySQL會按照常規的查詢方法執行，使用索引也無法提高查詢效率；而如果IN列表中的元素個數非常多，例如超過1000個，那么使用索引也無法優化查詢性能，反而可能會變得更慢。

因此，IN操作的最佳實踐是在IN列表中使用適量的元素，通常建議不要超過1000個，同時需要注意避免使用子查詢或者動態生成IN列表的方式。

除此之外，IN操作還需要滿足以下幾個條件才能使用索引：

- IN列表中的元素必須是常量，不能是變量、子查詢結果或者表達式結果；
- IN列表中的元素必須是同一數據類型，或者可以進行隱式或顯式類型轉換以滿足數據類型一致性；
- IN列表中的元素不能為NULL，否則即使使用了索引也無法提高查詢性能。

綜上所述，雖然MySQL的IN操作可以使用索引，但需要注意適量控制IN列表中元素的個數，并且要遵守一定的條件才能發揮出索引的優勢。