MongoDB和MySQL都是關系型數據庫管理系統(RDBMS)，但它們在很多方面有著巨大的差異。

MongoDB

MongoDB是一種文檔存儲數據庫，它可以很好地處理非結構化數據和半結構化數據。MongoDB的優點在于它使用了BSON(Binary JSON)格式來存儲數據，這種格式比JSON更小且更快速。另外，MongoDB還具有高度可擴展性和高可用性的特點，通過橫向擴展來適應數據量增長的需求。MongoDB的查詢語言是基于JavaScript的，雖然不像SQL、事務等傳統的關系型數據庫那樣強大，但足夠滿足常見的數據操作需求。

MySQL

MySQL是一種關系型數據庫管理系統，它使用SQL作為查詢語言，可以輕易地處理大量的結構化數據。MySQL的優點在于它穩定、可靠且易于使用，能夠支持多種操作系統和編程語言。MySQL還有著較好的數據一致性和可恢復性，支持事務處理和ACID屬性。MySQL是使用傳統的表格形式來存儲數據，因此對關系型數據的操作非常強大，并支持許多高級查詢用法。

總結

MongoDB和MySQL在不同的場景下都有著各自的優勢。MongoDB適合處理半結構化或非結構化數據，一些大型的Web應用程序或移動應用開發項目可以使用它。而MySQL則適合用于更常見的業務需求，尤其是對高質量互聯網資源管理有更嚴格的要求的企業級應用程序。總之，在選擇哪種數據庫系統時，最好基于實際需求和資源條件做出決策。