在Linux系統中，MySQL的配置文件是my.cnf。my.cnf文件可以用于配置MySQL服務器的各個方面，包括但不限于緩沖池、線程并發、查詢緩存、InnoDB存儲引擎、二進制日志、復制等等。因此，my.cnf文件是非常重要的配置文件。

示例my.cnf配置： 
[client]
port            = 3306
socket          = /var/run/mysqld/mysqld.sock
[mysqld]
user            = mysql
pid-file        = /var/run/mysqld/mysqld.pid
socket          = /var/run/mysqld/mysqld.sock
port            = 3306
basedir         = /usr
datadir         = /var/lib/mysql
tmpdir          = /tmp
log_error       = /var/log/mysql/error.log
# 開啟查詢緩存
query_cache_type = 1
query_cache_size = 512M
query_cache_limit=2M
# InnoDB優化
innodb_buffer_pool_size=256M 
innodb_log_file_size=128M 
innodb_flush_method=O_DIRECT
innodb_flush_log_at_trx_commit=2

如上例所示，my.cnf文件中的配置參數可以分為客戶端和服務器端兩個部分，客戶端參數主要用于配置客戶端的連接，而服務器端參數則囊括了大部分MySQL服務器特有的配置參數。

在Linux系統上，my.cnf通常位于/etc/目錄下，可以使用vim或者nano等文本編輯器打開進行配置。

# vim /etc/my.cnf

使用上述命令打開my.cnf文件進行配置時，需要注意遵循正確的語法規則。每個配置參數以方括號[]包含，后跟多個鍵值對，每個鍵值對用等號=連接。同時，使用“＃”進行注釋。