Linux系統下MySQL數據庫的關閉方法有多種，可以通過命令行方式關閉數據庫進程，也可以通過配置文件方式關閉。以下是具體步驟：

1. 命令行方式關閉數據庫進程
使用root或有關閉權限的用戶登錄MySQL數據庫，并執行如下命令：
# systemctl stop mysql
或者
# service mysql stop
該命令會關閉MySQL數據庫服務，停止所有正在運行的數據庫進程。
2. 配置文件方式關閉數據庫
打開MySQL數據庫配置文件my.cnf，找到[mysqld]部分，在其中添加一行語句：
# vi /etc/my.cnf
...
[mysqld]
...
skip-grant-tables
保存文件后，重新啟動MySQL數據庫服務：
# systemctl restart mysql
或者
# service mysql restart
此時MySQL數據庫已經關閉，可以通過一些特殊的方法重新打開。如果要永久關閉MySQL數據庫，需要從配置文件中刪除skip-grant-tables語句。