Java EE是一種基于Java平臺的企業級應用開發技術，它提供了一系列的API和規范，允許我們使用Java編寫跨平臺的企業級應用程序。其中，連接數據庫是Java EE應用程序最基本的任務之一，而MySQL數據庫是當今最流行的開源數據庫之一。

連接MySQL數據庫需要使用Java的JDBC接口。在Java EE中，我們可以使用JNDI數據源來管理數據庫連接。以下是Java EE中連接MySQL數據庫的示例代碼：

// 獲取數據源
Context initCtx = new InitialContext();
Context envCtx = (Context) initCtx.lookup("java:comp/env");
DataSource ds = (DataSource) envCtx.lookup("jdbc/mysql");
// 獲取連接
try(Connection conn = ds.getConnection()){
// 執行SQL語句
Statement stmt = conn.createStatement();
ResultSet rs = stmt.executeQuery("SELECT * FROM users");
while(rs.next()){
// 處理查詢結果
}
} catch (SQLException e) {
// 處理異常
}

在上述代碼中，我們首先獲取數據源。這里使用了JNDI技術，通過lookup方法查找我們在web.xml中配置的數據源。獲取到數據源之后，使用getConnection方法獲得連接。接下來就可以使用Connection對象執行SQL語句，并處理查詢結果了。

需要注意的是，在使用JNDI數據源時，我們需要先在web.xml文件中進行一些配置，例如配置數據源、驅動程序等。

總的來說，Java EE連接MySQL數據庫并不復雜，只需要掌握好JDBC接口和JNDI數據源的使用方法即可。對于Java EE開發人員來說，熟悉這些技術是非常必要的。