樓主你好，我是小小魚，感謝樓主邀請回答，不知道樓主用的是哪款的條碼打印軟件制作二維碼輸出PDF文件的，就以中瑯條碼打印軟件為例，

中瑯軟件在輸出PDF文檔，是可以選擇PDF文檔的壓縮方式的，總共有六種壓縮方式，我生成十萬個二維碼，分別用幾種壓縮方式輸出PDF文檔后進行對比

通過對比發現其中最快的壓縮方式，輸出PDF文檔是速度最快，不過輸出的PDF文檔較大，最好的壓縮方式，壓縮效果也是最好的，輸出的PDF文檔也較小，輸出PDF文檔速度相對較慢。

在中瑯條碼打印軟件中輸出PDF較大時還有另一種方法可以選擇，就是把輸出的PDF文檔進行拆分，比如十萬頁二維碼，按照頁數進行拆分，設置成一萬頁拆分一個，那么十萬二維碼就可以輸出十個PDF文檔，每個PDF文檔都有一萬個二維碼

通過上面的測試可以看出來，如果用中瑯條碼打印軟件生成二維碼輸出的PDF文檔較大是，可以對PDF文檔拆分，或者選擇相應的壓縮方式來解決這個問題，使用還是非常靈活的，而且軟件還支持PDF的合并功能，以上內容樓主可以參考下