實驗流程準則：

實驗時間：隱蔽站臺試驗一般設計天數為4天或者6天，如果是年老體弱鼠可以將天數設計為4天。訓練時間一般為60s或90s,也有用120s的，不過現在一般都改用60s了，有人做過實驗，大鼠在60～120s之間能夠找到隱藏站臺的次數差異大約只占其找到平臺總次數的5%,這在統計學上是“小概率事件”。也就是說,大鼠在60s內找不到隱藏站臺的話,再延長到120s也很難找到。而且60s還可以減小各組的標準差,可以節約實驗時間。但問題并非如此簡單，隱蔽站臺試驗潛伏期應采用重復測量,由于在統計時,很多研究將最大潛伏期直接納入統計,顯然,最大潛伏期的不同將不可避免地影響統計結果。所以從統計學上了解不同的最大潛伏期到底對Morris水迷宮實驗結果有多大的影響,如何避免因此帶來的系統誤差等問題尚有待進一步研究。國外文獻報道，如果水池的直徑在2m，可以設置單次訓練時間為120s,直徑在1m至1.5m,選擇訓練時間為60s,鑒于此，我們認為訓練時間60s較為合適。時間過長，對鼠體力消耗也會過大。

實驗次數：在隱藏站臺試驗中，每天訓練4次，每個象限每天只被使用一次，一定不要將大鼠連續地放入同一個象限，因為大鼠可能會憑借位置或其他非記憶信息（如向右轉彎）來定位站臺。而且，接下來每天的象限順序應當改變。在空間探索試驗中，將大鼠置于水池中追蹤120s，這個過程需要重復一次，因為在有些情況下，首次實驗會觀察到一些非正常變量，可能一些老鼠在改變了實驗條件后迷失了方向。連續進行的兩次實驗計算平均值可以減少偏差，可以提供一個較高的精度和對先前學習記憶的較好控制。但是如果實驗次數多于兩次，將會導致在目的象限活動時間減少，得到不準確的空間探索結果。

實驗動物：并非所有鼠株都適合于Morris迷宮測試，如近交系BALB/c小鼠不能學會該任務（成績并不隨天數的增加而進步），129/SvJ小鼠的學習成績也偏差；比如129/SvJ株的小鼠由于有年齡相關性視路病變，在衰老時完成以視覺為基礎的學習記憶任務時就會出現困難。在C57BL/6鼠，由于嚴重的禿頭癥存在，可能使某些小鼠產生抑郁，加上潰瘍性皮炎，最終可能影響小鼠的游泳能力而影響實驗成績；將動物浸入水中可能引起內分泌或其它應激效應，后者與腦損害或藥理學操作間的相互作用具有不確定性；由于體力消耗太大，體溫也喪失過多，一些年老體弱鼠完成任務較困難，甚至會發生溺水死亡的情況；另外，個體間的成績差異也巨大，比如說，有些正常大鼠放入水中后左右觀望打圈確定方向后直接游到臺上，說明他記憶力比較好，這個現象是很重要的，有的大鼠游泳速度慢些，所以潛伏期時間比癡呆組還大。所以可以先用別的方法把大鼠初篩一下，然后再來跑水迷宮。

實驗人員：實驗者應與受試動物建立良好的感情,讓動物熟悉實驗者的身體信息,如氣味、相貌等。捕捉動物的動作要溫柔,不要刺激動物。忌諱用手抓鼠的尾巴,因為這樣會極大的刺激動物。有人建議在實驗開始的兩三天之前,與鼠親密接觸。實際上鼠的嗅覺很敏感，如實驗人員為女性的話，其身上的香水味不同，都會使鼠的情緒發生變化的。