老話題對SA來說用perl還是python比較好？

從三個角度比較：

數據分析：指的是對數據過濾、格式轉換、關聯、統計的能力。處理不規則的數據，Perl 正則最強，python也不若，R 很差；R 和 Python 對矩陣（dataframe）形數據支持很強，不過我還是覺得 dplyr 比 pandas 好用一些；R 和 Python 統計能力也都不錯。可視化：Perl 繪圖弱爆了，R 有 ggplot，Python 有 matplotlib，如今也支持 ggplot。生信支持：對生信的支持指的是生物信息特有的一些分析，比如計算GC含量、取反向互補序列、富集、生存分析、WGCNA等。BioPerl 處理計算GC含量、取反向互補序列 這種比較擅長；BioPython 較弱，平時我用的只有讀取各種格式序列這個功能；而 Bioconductor 太強大了。

所以，R 無疑是必學的，Python 完全可以取代 Perl，但是看在很多年老的軟件使用 Perl 寫的份上，建議學會 Python，看懂 Perl。