在Java中，發布項目是非常重要的步驟。

通常情況下，Java項目發布指的是將項目打包成可執行的JAR文件，然后將這個JAR文件交付給其他人或部署到服務器上以供使用。

然而，Java應用目錄則是指運行Java項目時，JAR文件所使用的文件和目錄結構。

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├── lib
├── dependency1.jar
├── dependency2.jar
└── ...
├── resources
├── config.properties
├── logging.properties
└── ...
├── myapp.jar
└── README.md

在上面的目錄結構中，我們可以看到應用程序有一個主要的JAR文件（myapp.jar），以及用于存放項目依賴的“lib”目錄和存放項目配置文件的“resources”目錄。

當項目被部署到服務器上時，通常會使用配置文件和日志文件等構建一個獨立的目錄。這個目錄通常稱為“應用目錄”。該目錄包含了項目的所有文件和依賴項，是Java應用程序啟動和運行時需要的所有信息。

總之，發布Java項目和構建Java應用程序目錄是兩個不同的過程，但它們緊密相連，并且在項目部署和運行過程中都是非常重要的。