MySQL數據庫中，日志文件主要有以下幾種：

• 二進制日志（binlog）
• 錯誤日志（error log）
• 查詢日志（general query log）
• 慢查詢日志（slow query log）
• 中繼日志（relay log）

而在MySQL5.6版本中，日志文件的相關設置可以在my.cnf中進行：

log_bin = /var/log/mysql/mysql-bin.log      #開啟二進制日志
log_error = /var/log/mysql/mysql-error.log  #開啟錯誤日志
general_log_file = /var/log/mysql/mysql.log #開啟查詢日志
slow_query_log_file = /var/log/mysql/mysql-slow.log #開啟慢查詢日志
relay_log = /var/log/mysql/mysql-relay-bin   #開啟中繼日志
expire_logs_days = 10           #設置二進制日志文件的保留天數
max_binlog_size = 100M          #設置二進制日志文件的最大大小

其中，binlog記錄的是數據庫的修改操作，而error log記錄的是錯誤信息。查詢日志和慢查詢日志則會記錄數據庫的查詢操作，但慢查詢日志只會記錄查詢時間超過設定時間閾值的查詢。如果開啟了中繼日志，那么主從復制的過程中，中繼日志將記錄與傳輸有關的操作。

在MySQL5.6版本中，我們可以通過如下命令查看日志：

$ tail -100f /var/log/mysql/mysql.log #查看查詢日志
$ tail -100f /var/log/mysql/mysql-slow.log #查看慢查詢日志
$ tail -100f /var/log/mysql/mysql-error.log #查看錯誤日志

需要注意的是，日志文件的過多或過大可能會影響服務器的性能，因此我們需要定期刪除或壓縮舊的日志文件，或者設置expire_logs_days參數來自動刪除舊的二進制日志文件。