Java是一種面向對象的編程語言，其源代碼及編譯后的程序有著明顯的區別。

Java源代碼是由程序員編寫的，通過代碼編寫實現對程序的控制，包括程序的結構、變量類型、方法定義等。源代碼的代碼結構會直接影響編譯后的程序。

public class HelloWorld {
public static void main(String[] args) {
System.out.println("Hello, World");
}
}

Java編譯器會將源代碼編譯成Java字節碼，Java字節碼是一種中間形式，它不依賴于任何平臺，可以在任何未來的Java虛擬機（JVM）上運行。在編譯期間，編譯器會根據源代碼生成對應的字節碼文件和符號表。

public class HelloWorld {
public static void main(String[] args) {
System.out.println("Hello, World");
}
}

Java字節碼不是機器碼，它需要在JVM中被解釋或者編譯成原生機器碼才能被執行。因此，Java程序的執行性能與JVM實現、硬件和操作系統有關。

因此，源代碼和編譯后的程序都是Java開發中不可或缺的組成部分，它們的關系決定了Java程序最終的執行結果。