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python畫流感病毒

錢良釵1年前7瀏覽0評論

流感病毒是人類面臨的一種嚴重威脅,了解它的結構可以幫助我們更好地研究和防治這種病毒。Python語言中,我們可以使用Molecular Dynamics Studio(MDAnalysis)庫和Matplotlib庫來繪制流感病毒的結構。

# 導入需要的庫
import MDAnalysis as mda
import matplotlib.pyplot as plt
# 讀取流感病毒PDB文件
flu = mda.Universe("flu.pdb")
# 獲取所有蛋白質結構
prot = flu.select_atoms("protein")
# 繪制蛋白質結構
fig, ax = plt.subplots()
for atom in prot:
ax.scatter(atom.position[0], atom.position[1], s=1, c=atom.element)
plt.show()

以上代碼可以讀取下載好的流感病毒PDB文件,并使用MDAnalysis庫來獲取其中的蛋白質結構。然后,我們使用Matplotlib庫來將這些結構繪制在坐標系上。其中,ax.scatter()函數用于繪制點,s參數是點的大小,c參數是點的顏色。

通過這段代碼和繪制出的圖片,我們可以更直觀地了解流感病毒的結構,這有助于我們更好地研究和防治這種病毒。