MySQL是一個開源的關系型數據庫管理系統，而PHP是一種通用的腳本語言，它們兩者可以進行相互配合，其中最重要的一種配合方式就是通過使用PHP連接MySQL數據庫。

連接MySQL數據庫最常用的方式就是使用mysqli這個擴展庫（PHP 5及以上版本自帶）。我們來看一個簡單的例子，連接到某個數據庫并查詢其中的一張表中的所有數據：

$servername = "localhost";
$username = "root";
$password = "";
$dbname = "myDB";
// 創建連接
$conn = new mysqli($servername, $username, $password, $dbname);
// 檢測連接
if ($conn->connect_error) {
die("Connection failed: " . $conn->connect_error);
}
$sql = "SELECT * FROM MyGuests";
$result = $conn->query($sql);
if ($result->num_rows >0) {
// 輸出數據
while($row = $result->fetch_assoc()) {
echo "id: " . $row["id"]. " - Name: " . $row["firstname"]. " " . $row["lastname"]. "
";
}
} else {
echo "0 results";
}
$conn->close();

在上述例子中我們先使用mysqli()函數創建一個MySQL連接對象$conn，然后在查詢數據后使用$result對象對查找的數據進行處理。如果我們發現結果集不為空，我們使用while循環循環輸出行內容。

這個例子只是一個最基礎的連接MySQL數據庫的例子，其中有許多需要注意的事項。如果應用有對不同數據庫的連接需求，通常需要對連接對象的初始化做修改，比如設置字符編碼和調整安全要求等。連接對象還可以有許多其他的調用方式，比如更多的數據庫查詢方式（例如使用PDO擴展庫），但這些調用具體取決于應用程序的需求。

綜上所述，MySQL與PHP是非常緊密的開源項目，它們兩者可以通過各種不同的方式進行配合，其中最常見的方式就是使用PHP連接MySQL數據庫。如果我們能夠充分時刻地熟悉MySQL數據庫和PHP編程語言及其相關的擴展庫，就可以讓我們的網站應用升華到更好的層次。