MVC架構是Web應用程序最常用的一種架構，根據它的三個核心組成部分Model、View、Controller的不同作用，將應用程序的邏輯分離，使得它們之間沒有耦合。其中，Model層主要負責數據的存儲和修改，View層負責數據的展示，Controller層則負責控制數據的流向。

而在PHP中，對于Web應用程序的數據持久化存儲，最常用的是Session。它以鍵值對的形式保存在服務器端，并且可以在多個頁面之間共享數據。例如，當用戶在登錄后，我們可以通過將用戶的信息存儲在Session中，使得用戶在訪問其他頁面時仍然可以保持登錄狀態。

在MVC架構中，Session的應用也是十分常見的。比如在Controller控制層中，我們可以通過使用$_SESSION來存儲數據。例如，當用戶登錄成功后，我們可以將用戶的信息存儲在Session中：

//登錄成功后將用戶信息存儲在Session中
$_SESSION['user'] = array(
'username' =>'Tom',
'password' =>'123456'
);

但是需要注意的是，在使用Session時，一定要開啟Session。否則，無法使用$_SESSION來存儲和讀取數據。可以通過調用session_start()函數來開啟Session。例如：

//開啟Session
session_start();

在Model層中，我們同樣可以使用Session來實現一些操作。例如，當我們需要在不同的Model層操作中共享數據時，就可以使用Session。

//將數據存儲在Session中
$_SESSION['data'] = array('name' =>'張三', 'age' =>18);

當然，對于Session的使用，還需要特別注意它的安全性。因為Session數據存儲在服務器端，所以可以減少一些安全風險，但是也需要注意。比如，Session ID可以通過Cookie或URL傳遞，如果Session ID泄露，就會導致Session的安全受到威脅。

總的來說，Session在MVC架構中，扮演著重要的角色。它不僅可以實現數據的持久化存儲和共享，還可以避免一些安全問題。但是在使用時，還需要特別注意一些安全方面的問題，以免給應用程序帶來風險。