Java是一款廣受歡迎的編程語言，而在開發Java應用程序過程中，源碼文件和目標文件是非常重要的組成部分。

源碼文件

，就是Java程序員編寫的代碼文件。Java源碼使用.java擴展名，包含了完整的Java代碼，它可以被Java編譯器編譯成可執行的目標文件。

目標文件

也稱作類文件或二進制文件，使用.class擴展名。目標文件是Java編譯器編譯源碼后生成的文件，其中包含了已編譯的Java代碼和其他相關信息，例如類的訪問修飾符、返回類型、方法參數等。Java目標文件可以在Java虛擬機上執行。

在編寫Java程序時，可以通過指定編譯器選項來進行源碼文件和目標文件的控制，如指定編譯源碼文件的版本，生成目標文件的平臺等。這些選項可以被寫入命令行以及Ant或Maven等構建工具的配置文件中。

一些Java IDE（集成開發環境）也提供了方便的界面，幫助開發人員創建和管理源碼和目標文件。例如，Eclipse提供了源碼和目標文件的準確關聯，并且可以為用戶創建和管理Java包。