在MySQL中，ibdata1是一個非常重要的文件，它存儲了MySQL整個實例中的表空間、InnoDB表和索引等信息。因此，在一些情況下，我們可能需要刪除這個文件。

但在刪除之前，需要注意以下幾點：

1. 全局表空間是必須的，不要刪除。
2. 如果您有InnoDB文件格式的表，則不要刪除。
3. 確保您有充足的備份，在意外情況下可以恢復您的數據。

如果您確信可以刪除ibdata1文件，則可以按照以下步驟執行：

1. 將MySQL服務停止
2. 將原來的ibdata1重命名（備份）
3. 刪除ibdata1
4. 修改my.cnf配置文件：
innodb_file_per_table=1
innodb_data_file_path = ibdata1:10M:autoextend
（這會讓MySQL以新的方式創建表空間）
5. 啟動MySQL服務

這樣操作后，MySQL會自動創建一個新的ibdata1文件，并且每個InnoDB表都將有一個獨立的表空間文件。同時，我們還可以通過手動刪除舊表空間文件的方式，釋放磁盤空間。